
2024年9月由苏州渔业高校张万刚先生项目团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物技术为该研究提供了亚硝基化呈现组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
简体中文题目:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2026年干扰细胞:5.7
先生发表时段:2024年9月
用户组织:南京农业大学
研究分析素材:蛋白
拜谱给出科技:亚硝基化修饰组学
技巧规划:
一、研究分析毕竟
01.Caspase-3化学活化
当今尚不了解清楚NO对caspase-3的调节用途什么情况下归因于NO介导的S-亚硝基化,各不相同氧浓度系数的GSNO是外源性NO供货,以诱导性caspase-3的体内S-亚硝基化。但是证明,与是没有GSNO的组相对来说,100、200和400μM GSNO组的caspase-3灵几丁质酶为显著减低(图1),与之前了解同步。GSNO加工处理减低caspase-3灵几丁质酶的未知原因仍亟待确立。
图1 不一氧化还原电位的GSNO治理对caspase-3活力的影向
02.Caspase-3的S-亚硝基化程度上
理论论述Caspase-3的亚硝基化成度,以阐述GSNO对Caspase-3的症状性。经GSNO进行处理后,查测到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化构造多(图2)。他们报告单是因为,外源性GSNO养育可成功的英文引导caspase-3的身体外S-亚硝基化。使人惊喜的是,在就没有GSNO有着的比组中查测到一两个忽闪的S-亚硝基化带,这是因为caspase-3可能性时有发生内源性的S-亚硝基化。前者,本理论论述中caspase-3的S-亚硝基化成度较高,而caspase-3的抗逆性变低,这与时候的理论论述共同。因此,caspase-3的特异形S-亚硝基化绘制位点尚不了解清楚,还需进一点的不断探索。
图2 GSNO解决对caspase-3S-亚硝基化品质的关系
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化装饰组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。紫色箭头的字段带表S-亚硝基化肽,红箭头的C带表S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3降解塑料结蛋白质
结蛋清看作一款首要的生殖上皮细胞骨架蛋清,在能维持肌生殖上皮细胞架构的架构详尽性和收缩毛孔性上起着首要功效,设计S-亚硝基化caspase-3对结蛋清吸附的过敏性兼备首要积极意义。与Std(未用胱天蛋清酶-3和GSNO孵育的初使肌弹性玻纤蛋清)组想必,0 μM GSNO组(肌原弹性玻纤和caspase-3的孵育,无GSNO)的详尽结蛋清含氧量更为明星降低,报错caspase-3对结蛋清兼备不确定的蛋清电离技能。在GSNO孵育后,详尽结蛋清的含氧量明星多(P < 0.05)。显然,当GSNO氨水浓度变高时,详尽结蛋清的含氧量连续调涨(P < 0.05)(图5)。相应显示呈现,SNO呈现的caspase-3以水平方向依耐的方案抑制作用结蛋清的吸附。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结血清
05.S-亚硝基化Caspase- 3吸附肌钙蛋清-T
肌钙血清-T (TnT)是原肌球血清调准主要负责腿部肌肉紧缩的细条的必备肌原氯纶血清。TnT的化学挥发塑料功能是监测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化的条件下,caspase-3对TnT的化学挥发塑料情况报告如下图所显示6所显示,与Std组(只含caspase-3和GSNO的肌原氯纶)相比之下,caspase-3组中30 kDa TnT情节明显的增强,反映caspase-3根据了TnT的化学挥发塑料,前者,caspase-3与GSNO的孵育引发30 kDa TnT的有效调低。在100和200 μM GSNO组相互之间没了监测到明显的的对比(P > 0.05),而当GSNO的有机废气浓度实现400 μM 时,该情节明显的减小(P < 0.05)。这遇到反映了SNO掩盖的caspase-3对TnT化学挥发塑料的克拍摄用。结血清和TnT是caspase-3的刺激性底物,而GSNO除理有效调低caspase-3的活力酶类也许引发肌原氯纶血清化学挥发塑料程度较有效调低。结合以上表明,NO引诱的S-亚硝基化需要根据掩盖半胱氨酸残基来调准caspase-3的活力酶类,行而进十步作用其对结血清和TnT的血清电离性能,进而作用牛羊肉品级。
图6. S-亚硝基化caspase- 3可降解肌钙球蛋白-T
二、工作小结
本研究试论为了更好地试论S-亚硝基化对caspase-3装饰语的的直接影响以及紧接着对鸡肉片肌原玻璃纤维板休外溶解的的直接影响。球蛋白质酶S-亚硝基化都可以装饰语caspase-3的半胱氨酸残基,因而引致caspase-3生物拉低,进十步能够抑制了其对鸡肉片肌原玻璃纤维板球蛋白质酶的球蛋白质酶水解反应功能。三、拜谱总结ppt
调查适用了酶活查测,亚硝基化装饰组学数据分析,WB等查测途径,表明蛋清S-亚硝基化会装饰caspase-3的半胱氨酸残基,这造成了caspase-3活力性的减少,齐头并进一部可以抑制了其对鸡肉肌原氯纶蛋清的蛋清蛋清质水解工作能力。本调查为理解蛋清质亚硝基化对吃起来的监测制度给予新一个新的视域。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清酶质组学、绘制血清酶质组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸款型产品设备,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total钝化完美重现、解离巯基,欢迎大家咨询!
参照文献综述:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663