在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

探究可是

1、从光敏教育培养细胞核中生成DNA交连高蛋白质

要转移光交连营养素质-DNA挽回物使用在LC-MS介绍，笔者联合开发好几回种男变女纯化设计方案，可从DNA中去必须交连营养素质，仅在光照时经过可以DNA组碰触聚集DNA交连营养素质。用TRIZOL弄掉印染质并弄掉入狱获的非交连营养素，进而将其全新消融以来RNase助消化酶。经过超声检查截取视频应纳税所得额营养素质交连DNA的弄掉物，在硫氰酸胍中烧开男变女，并在二脱色硅离心式柱上猛烈洗衣以去必须交连营养素质就此已完成。经过核酸酶治理 从DNA中挥发释放光交连营养素，并来胰营养素酶助消化酶使用在LC-MS介绍。该技巧取名为营养素质交连DNA弄掉或XDNAX。

图1.球营养素化学交联DNA提炼或XDNAX程序流程（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可一直了解DNA的球蛋白质含量图谱

将光交连技巧用于MCF7细胞膜膜，察觉到了1,805种侯选人蛋清，在其中1,191种会存在于3个或许多次重新中。60%的DNA相互间效应组可能含有核酸整合的GO注解，在不足核酸整合注解的蛋清质中，大的贡献奖来核纤层蛋清，后者是进行上色质进行和细胞膜膜分列的蛋清质（图2）。

图2 . 可马上沾染 DNA 的蛋白酶质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3工作小结了DNA双方功用组所抽象性的蛋清质-DNA操作界面极其带有的核苷酸交连肽。这比如因为（1）球状DNA根据框架域、（2）DNA 根据起居不规律区（IDR）和（3）因为与同一蛋清质（诸如组蛋清根据蛋清）、RNA（诸如剪接指数公式）或相离心分离区室（诸如核仁蛋清）双方功用而从而导致的区域环境将近。

图3 . 可直接的遇到 DNA的设计域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法细胞系扰动时间与DNA联系的转录细胞因子

雌荷尔蒙肾上腺素受体α（ESR1）驻留下来胞质溶胶中，到最近会遇到其配体，引发易位到癌癌体细胞质，在这里它与基因组组中的某地域依照以影响启动某的转录软件。将血清饥饿的MCF7癌癌体细胞裸漏于高摄入量雌荷尔蒙（10 nM 17β-雌二醇）4两半个小时，与模拟仿真加工的剖析癌癌体细胞非常其的DNA彼此之间目的组（图4A）。这其中，雌荷尔蒙影响后DNA彼此之间目的组中的ESR1不断增加了30倍（图4B）。总的我认为，在1,814个酶联免疫法的球膳食纤维-DNA彼此之间目的中，约有9%彰显出突破2倍的明显转变，并观擦到与ESR1都具有彼此之间目的的球蛋白质如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌肾上腺素加工处理乳房增生恶性肿瘤膜 DNA 上下级影响组的按量更加（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结ppt

探讨探讨实行遗传表观遗传组的蛋清酶酶质以熟知 它是怎么样才能被获取并付诸实训的，经常是探讨工作人员个长期性的认为。遗传表观遗传组可及性主要的以DNA为重点的角度来实行探讨探讨，而是，到如今到止，着色质妇科凝胶中的哪几个蛋清酶酶质与DNA 发生了电磁学彼此效果尚不清除。适用零离光热塑，可察觉DNA彼此效果组中的基本数蛋清酶酶质，XDNAX枝术将作蛋清酶酶质-DNA彼此效果探讨探讨的强大的平台。

拜谱总结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的球蛋白质含量组学、体现组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

学习文献资料：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.