代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
部份检测：细胞代谢率组学科技够对草药中的普通机械工业部份做好详细研究分析，检测出药草中的活性酶氧部份。举例，利用率对于质谱（MS）的细胞代谢率组学科技，可能检测出红参中的红参皂苷等活性酶氧部份。此类科技还可能辨认中药配方价值和非中药配方价值部份的普通机械工业符号物，为草药的性能管理出示理论依据。
质理水平操控：依据产生组学技术性，能对中草药配方的质理水平使用估评和操控。列如，使用苔藓沉水植物产生组学分折，能发展涉及类骨质增生性骨节炎的中草药配方化学上化学上基本成分的质理水平标上的参考值最简单的方法。因此，产生组学还能辨认中草药配方中的致癌性化学上化学上基本成分举例致癌性系统，如依据UPLC-Q-TOF-MS研究分析，辨别区别乌头苔藓沉水植物的化学上化学上化学上基本成分，并辨认兼具镇痛药抗逆性和急性膀胱致癌性的生物制品碱。
2. 中药药效机制研究
用处靶点分辨：分泌组学技术水平就可以助力分辨西药催化活性组成的碳原子靶点。比如说，深入分析感觉雷公藤红素可使用自动调节Treg/TH1和Treg/Th17取舍、中医NF-κB环路等体系更好地发挥抗感染用处。
效果制度化诠释：新陈基础排泄组学技巧还能够 阐明西药调理急病的效果制度化。譬如，科学科研发觉青蒿素耐药性与疟原虫的线粒体新陈基础排泄该变有关的，非靶向治疗新陈基础排泄组学阐明了与该时有关的新陈基础排泄物发展。虽然，新陈基础排泄组学还能够 使用了解新陈基础排泄物的发展，科学科研西药复方的效果制度化。
3. 中药安全性评价
毒副作用体系科研：细胞新陈基础代谢组学水平可用做科研中药茶的毒副作用体系。列如，确认细胞新陈基础代谢组学和16S rDNA测序的合并了解，证明了清益汤对危重急慢性胰腺炎有关急慢性肺磨损的保护好体系，并判定了铁镇定、不一致性细胞新陈基础代谢物和细菌制品菌群期间的相关。
防护性鉴定：分解代谢组学技艺还能否采用中西药的防护性鉴定，认别暗藏的渗透性基本成分和渗透性靶点，最终得以为中西药的防护适用出具小学科学前提。
4. 中医证候研究
证候一些排泄物探讨：排泄组学高技术可适用于分析方法与老中医妇科证候一些的内源性排泄物变迁，辅佐老中医妇科证候的诊断报告和行为矫正。列如，依据排泄组学探索，已在冠心脏病用户中鉴定会出与痰瘀证和气流阴两虚证一些的生物学标准物。
证候预防设计：消化吸收组学水平还就才可以采用设计中成药对医学证候的预防郊果。诸如，在消化吸收组学水平及聚类算法定性分析法，得知“黄芪-茯苓-泽泻”等相关内容药剂量选用适采用肾病总合征的新组方药剂量，才可以对多种不同肾病总合征相关内容的动物标志牌物造成影向。
5. 多组学技术整合应用
两组学资源共享：分解代谢组学与某个组学系统（如染色体组学、转录组学、核营养素组学等）的资源共享软件，为中葯才方学习出示一个多个多方面的深入分析前端框架。这样资源共享软件既加重了咱们对中葯才方部分在原子层面上上对人身体和方面的问题的情况的关系，且为阐述中葯才方的做用新机制和药力物核心出示了强强而有力的器具。
发病的中药治疗规则：几组学水平都可以用以探索中药方的中药治疗发病的大分子规则。举例说明，使用营养物质质组学和排泄组学的共同用，具体分析了与中醫细分的膝骨节骨性骨节炎紧密关于的相互影响表述营养物质和排泄通道。
新陈代谢组学技术性在中葯研究探讨中的应用软件，为中葯的如今化和有目的医辽具备了最重要的完美适用，助于推向中葯的规格化和知名化发展前景。