
近日,武汉医科高中最付属医阮王学浩院土专业团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗能量场分解代谢检测分析服务。
用英文怎么说版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
的客户行业:南京医科大学
学习村料:细胞
拜谱可以提供服务管理:转录组测序+核蛋白互作组+靶点人体脂肪分泌组
技术应用自驾线路:
研发毕竟
01、YBX1被签别为HCC中糖酵解的主要人类基因
本研究方案终端采集HCC肉瘤样表(n=7)的单血公司体细胞RNA测序数剧集去研究研究,看到糖酵解活力性注意集中在在肉瘤血公司体细胞中,hdWGCNA研究研究设别出9个人类基因传感器(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的环境研究研究选定YBX1为单独环境风险隐患问题(图1H)。进一个步骤结合实际IHC、WB实验设计和肉瘤公司与紧邻非肉瘤公司的三维空间转录组学数剧集确认YBX1是肝血公司体细胞癌诊疗的潜在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判定为改善HCC体细胞糖酵解的主要原则
02、YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗热量分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1促使HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1构建并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合实际并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增加其磷酸性反应,导致有助于其核转位
进而骤的检测YBX1的O-GlcNAc糖基化是否需要决定其磷碱化,在OGT敲低的HCC内部中或用OGT压溶液剂OSMI-1净化操作,YBX1淀粉酶技术同质性降低,YBX1磷碱化同质性削减(图4A-C)。IP实验性体现,在一模一样的Flag-YBX1底物技术下,YBX1-WT的磷碱化技术同质性超出YBX1-T57A,揭示磷碱化的不断增加往往仅是毕竟更高些的YBX1淀粉酶传达(图4D)。分离出来了核和质酚类化合物察觉到TMG净化操作的HCC内部中YBX1核传达的增加(图4E-F),进而骤察觉到YBX1磷碱化的要素的调节系数是AKT(图4G-I)。等察觉到表示O-GlcNAc糖基化依据可以淡化其磷碱化来力促YBX1淀粉酶平衡性并可以淡化核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖语影响于其进的一步的发生磷碱化掩盖语并可带动其核转位
05、YBX1催进PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有助于PKM2转录
06、YBX1 可能增加组血清乳硝化作用装饰品质
科研发现YBX1敲低同质性大幅度较低核氨基酸乳硝化为用,越发是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解限药物2-DG的实践表明了糖酵解与组核蛋白质乳硝化为用的会可以直接相关,限制糖酵解可同质性大幅度较低H3K18la技术水平(图6D)。PKM2过理解不可逆转转YBX1敲低引致的H3K18la下滑,之外源乳酸加工实际上提高自己H3K18la,还持续性YBX1理解上涨,表明会出现正向着反应(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR表明,H3K18la经过聚集于YBX1启动时子会可以直接增进其转录,该整个过程受O-GlcNAc糖基化国家宏观调控(图6H-J),潜在现P300 上涨是YBX1激发H3K18乳酰化为用的机理(图6K-L)。
图6.YBX1增强学习H3K18乳硝化作用装饰水平面
优秀文章总结
在这般科学研究中消息了YBX1在HCC中高形容,如果与糖酵解开切对应。YBX1在T57处被O-GlcNAc遮盖,才能安稳胆固醇质并多其形容。这般遮盖还推进会YBX1在T57处的磷碱化,推进会其核易位。之所以,这种阶段加强了糖酵解对应表观遗传的转录并的刺激乳酸的发生。还有,YBX1成功激活P300的转录,因而能够组胆固醇的乳碱化,很是H3K18la,H3K18乳碱化正在向国家宏观调控YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病双面馈环逻辑图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向药物力量代谢率组技术服务,拜谱海洋生物建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、翻譯后体现组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参看毕业论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.